Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTF1Q15361 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF1Q15361 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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