Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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