Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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