Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIXQ14938 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
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