Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IHHQ14623 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IHHQ14623 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IHHQ14623 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IHHQ14623 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IHHQ14623 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IHHQ14623 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms