Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms