Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT6Q14141 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT6Q14141 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms