Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCNIQ14094 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCNIQ14094 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCNIQ14094 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCNIQ14094 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCNIQ14094 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CCNIQ14094 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNIQ14094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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