Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX39BQ13838 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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