Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOFQ13790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOFQ13790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOFQ13790 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOFQ13790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOFQ13790 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOFQ13790 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOFQ13790 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOFQ13790 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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