Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA3CQ13748 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TUBA3CQ13748 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TUBA3CQ13748 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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TUBA3CQ13748 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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