Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IKZF1Q13422 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms