Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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