Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRSQ13332 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRSQ13332 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms