Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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MRPL28Q13084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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