Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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