Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP1Q12981 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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