Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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