Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF1Q12946 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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