Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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