Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 HOYDL227C 1761 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 BDP1YNL039W 1785 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 TAF10YDR167W 621 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YFT2YDR319C 825 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 ELO3YLR372W 1038 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 HEK2YBL032W 1146 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YNL143CYNL143C 393 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 ISA2YPR067W 558 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 OM14YBR230C 405 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 SEN1YLR430W 6696 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 FAR10YLR238W 1437 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 THI7YLR237W 1797 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 XKS1YGR194C 1803 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 BUD25YER014C-A 462 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 PIC2YER053C 903 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 COX18YGR062C 951 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 RPS4BYHR203C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 RPS4AYJR145C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YMR315WYMR315W 1050 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 DSS4YPR017C 432 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YNR065CYNR065C 3351 nt4.01□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 DEG1YFL001W 1329 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 OAF1YAL051W 3144 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 MCM2YBL023C 2607 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 FKH1YIL131C 1455 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YDR274CYDR274C 372 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YER085CYER085C 522 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YNL181WYNL181W 1224 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 SVF1YDR346C 1446 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 RAD1YPL022W 3303 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 FLC1YPL221W 2382 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 APM1YPL259C 1428 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 NUG1YER006W 1563 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 TMN2YDR107C 2019 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 MMT1YMR177W 1533 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 GGA1YDR358W 1674 nt4□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 RKM4YDR257C 1485 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 CLD1YGR110W 1338 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 KIN2YLR096W 3444 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 GAS4YOL132W 1416 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 KTR2YKR061W 1278 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 NAT3YPR131C 588 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 RSC58YLR033W 1509 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 KEX1YGL203C 2190 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 BRE4YDL231C 3378 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 IKS1YJL057C 2004 nt3.99□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 DSD1YGL196W 1287 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 SRB5YGR104C 924 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YIL163CYIL163C 354 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YJR038CYJR038C 363 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 GPI12YMR281W 915 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 TAF12YDR145W 1620 nt3.98□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 ZRC1YMR243C 1329 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 DHH1YDL160C 1521 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YML020WYML020W 1995 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 TMA17YDL110C 453 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 SEC72YLR292C 582 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 SPN1YPR133C 1233 nt3.97□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 EMP47YFL048C 1338 nt3.96□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 HOS3YPL116W 2094 nt3.96□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 GIP4YAL031C 2283 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 ELO2YCR034W 1044 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 AIM7YDR063W 450 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MIC26YGR235C 702 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 WSS1YHR134W 810 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YJL218WYJL218W 591 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 PSR1YLL010C 1284 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YOR131CYOR131C 657 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YPL077CYPL077C 723 nt3.96□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 ADP1YCR011C 3150 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MEF2YJL102W 2460 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 snR7-LsnR7-L 214 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 TIM21YGR033C 720 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 LSB1YGR136W 726 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SOL4YGR248W 768 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 RPL8AYHL033C 771 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 CYC1YJR048W 330 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MRPL3YMR024W 1173 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SHE1YBL031W 1017 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SET6YPL165C 1122 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 OCT1YKL134C 2319 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 ARO80YDR421W 2853 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YLR152CYLR152C 1731 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MET17YLR303W 1335 nt3.95□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 CWH43YCR017C 2862 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YER067C-AYER067C-A 324 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SNO1YMR095C 675 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SIW14YNL032W 846 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YPR174CYPR174C 666 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YPS7YDR349C 1791 nt3.94□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 LOS1YKL205W 3303 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MCP2YLR253W 1710 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YDL228CYDL228C 642 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SPC19YDR201W 498 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 CAF16YFL028C 870 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MMS2YGL087C 414 nt3.93□□□□□ -1.78
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