Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CGNL1Q0VF96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms