Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms