Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMOD3Q0VAK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms