Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms