Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF415Q09FC8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF415Q09FC8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF415Q09FC8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF415Q09FC8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF415Q09FC8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF415Q09FC8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms