Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms