Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD47Q08722 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD47Q08722 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD47Q08722 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD47Q08722 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms