Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 BUD16YEL029C 939 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YER187WYER187W 426 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 ACT1YFL039C 1128 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YGL185CYGL185C 1140 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 CDC12YHR107C 1224 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YJR038CYJR038C 363 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 POS5YPL188W 1245 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 MNT2YGL257C 1677 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 ALG2YGL065C 1512 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 TDA11YHR159W 1515 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 NTA1YJR062C 1374 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 UBA1YKL210W 3075 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 IRC22YEL001C 678 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 ECM33YBR078W 1290 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 ABD1YBR236C 1311 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 MPS3YJL019W 2049 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 KRE29YER038C 1395 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 TYW1YPL207W 2433 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YNL095CYNL095C 1929 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 OCA4YCR095C 1089 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SAY1YGR263C 1275 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YMR315WYMR315W 1050 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 KRE6YPR159W 2163 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 CYK3YDL117W 2658 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 snR7-SsnR7-S 179 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SEM1YDR363W-A 270 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 RPB7YDR404C 516 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 LOH1YJL038C 660 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 DSS4YPR017C 432 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 BUD8YLR353W 1812 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 LEU1YGL009C 2340 nt5.15□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 EXO1YOR033C 2109 nt5.15□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 RAD7YJR052W 1698 nt5.15□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 COP1YDL145C 3606 nt5.15□□□□□ -1.58
SSP2Q08646 SPC3YLR066W 555 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 PPG1YNR032W 1107 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 MDY2YOL111C 639 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 MET17YLR303W 1335 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 PUS9YDL036C 1389 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 YMR1YJR110W 2067 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 IME4YGL192W 1803 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 DAS2YDR020C 699 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 SFH5YJL145W 885 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 VPS71YML041C 843 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 BUB3YOR026W 1026 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 COX11YPL132W 903 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CMR3YPR013C 954 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 IKS1YJL057C 2004 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 FBP26YJL155C 1359 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 AXL2YIL140W 2472 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 IMA1YGR287C 1770 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CRT10YOL063C 2874 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 STB2YMR053C 2553 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 NSE3YDR288W 912 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CYC1YJR048W 330 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 YJR085CYJR085C 318 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 YOL024WYOL024W 519 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CDC4YFL009W 2340 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 TRM13YOL125W 1431 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CWH43YCR017C 2862 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 STR2YJR130C 1920 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 SOF1YLL011W 1470 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 YOL075CYOL075C 3885 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 PTC1YDL006W 846 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 DIN7YDR263C 1293 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CDC42YLR229C 576 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 ELO3YLR372W 1038 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 FBP1YLR377C 1047 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 RSC58YLR033W 1509 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 GAL4YPL248C 2646 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 CDC9YDL164C 2268 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP2Q08646 PER1YCR044C 1074 nt5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms