Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms