Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FMODQ06828 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FMODQ06828 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms