Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPAQ06546 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPAQ06546 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPAQ06546 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPAQ06546 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPAQ06546 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GABPAQ06546 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms