Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
EXOSC9Q06265 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EXOSC9Q06265 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms