Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCQQ04759 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms