Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN1Q04323 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms