Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 RTK1YDL025C 1863 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 NOP8YOL144W 1455 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MDM38YOL027C 1722 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 SER33YIL074C 1410 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 SLM4YBR077C 489 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 TAF12YDR145W 1620 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 PUT2YHR037W 1728 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 NRD1YNL251C 1728 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 GLN4YOR168W 2430 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MDM10YAL010C 1482 nt5.25□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 THI7YLR237W 1797 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 BOI2YER114C 3123 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YCR101CYCR101C 549 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 NUP42YDR192C 1293 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 THI5YFL058W 1023 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 DCG1YIR030C 735 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 TDA5YLR426W 981 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 THI12YNL332W 1023 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 WRS1YOL097C 1299 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 CUE5YOR042W 1236 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 CNS1YBR155W 1158 nt5.24□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 IDS2YJL146W 1410 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 JAC1YGL018C 555 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 ARO2YGL148W 1131 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 SDT1YGL224C 843 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MRP4YHL004W 1185 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YMR084WYMR084W 789 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YOL107WYOL107W 1029 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 TAZ1YPR140W 1146 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MDR1YGR100W 2853 nt5.23□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YMR111CYMR111C 1389 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 PHO13YDL236W 939 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 TRS23YDR246W 660 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 EBP2YKL172W 1284 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 HYM1YKL189W 1200 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 AAH1YNL141W 1044 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YNL296WYNL296W 315 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 FEX1YOR390W 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MET31YPL038W 534 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 FEX2YPL279C 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 MNN1YER001W 2289 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 PRP19YLL036C 1512 nt5.22□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 BCH2YKR027W 2298 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 HAT2YEL056W 1206 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 HEK2YBL032W 1146 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YNL174WYNL174W 573 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SSU72YNL222W 621 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 AIM39YOL053W 1188 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 TRM10YOL093W 882 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MED7YOL135C 669 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SPS4YOR313C 1017 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 STV1YMR054W 2673 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PAN1YIR006C 4443 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 GSY1YFR015C 2127 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 HMS1YOR032C 1305 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PRP9YDL030W 1593 nt5.21□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SRS2YJL092W 3525 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 CDC15YAR019C 2925 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 UGA2YBR006W 1494 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YAP1802YGR241C 1707 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 RRG1YDR065W 1098 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 RPL28YGL103W 450 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 IMP3YHR148W 552 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YKL177WYKL177W 339 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 GCD7YLR291C 1146 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YMR010WYMR010W 1218 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MER1YNL210W 813 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YNL226WYNL226W 411 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 snR37snR37 386 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 UGA3YDL170W 1587 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PTM1YKL039W 1572 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 RRP14YKL082C 1305 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SRO9YCL037C 1305 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SLM5YCR024C 1479 nt5.2□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YMR1YJR110W 2067 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 STB3YDR169C 1542 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 NUS1YDL193W 1128 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MRF1YGL143C 1242 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YGR219WYGR219W 342 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 VPS29YHR012W 849 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SEC28YIL076W 891 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 LAC1YKL008C 1257 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 CPR6YLR216C 1116 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YML119WYML119W 1074 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YBL036CYBL036C 774 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 CDC21YOR074C 915 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YBR016WYBR016W 387 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 ATG29YPL166W 642 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PRD1YCL057W 2139 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 HOM3YER052C 1584 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 CLN2YPL256C 1638 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YMR102CYMR102C 2505 nt5.19□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SAT4YCR008W 1812 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SEG2YKL105C 3399 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 ALE1YOR175C 1860 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.4 ms