Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms