Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPARDQ03181 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms