Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP4Q02446 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP4Q02446 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SP4Q02446 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP4Q02446 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP4Q02446 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP4Q02446 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP4Q02446 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP4Q02446 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP4Q02446 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms