Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIBQ01892 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms