Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550.3 ms