Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL1Q00532 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms