Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDLBPQ00341 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms