Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAP84074 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAP84074 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPCAP84074 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAP84074 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAP84074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAP84074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAP84074 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPCAP84074 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPCAP84074 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPCAP84074 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPCAP84074 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPCAP84074 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms