Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM4P67936 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM4P67936 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM4P67936 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM4P67936 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM4P67936 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms