Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO1P63165 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms