Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms