Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms