Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS13P62277 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS13P62277 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS13P62277 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS13P62277 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS13P62277 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS13P62277 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS13P62277 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms