Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO2P61956 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO2P61956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms